0. パッケージの読み込み

生存時間解析の実行と結果の描画には以下のパッケージを使用している。

• survivalパッケージ
  
• flexsurvパッケージ
  
• ehaパッケージ
  
• metsパッケージ
  
• flexsurvパッケージ
  
• ggsurvfitパッケージ
  
• survminerパッケージ
  
• tidycmprskパッケージ
  
• coxmeパッケージ
  
• rstanarmパッケージ

## 生存時間分析
library(survival)
library(eha)
library(flexsurv)
library(rstanarm)
library(cmprsk)
library(coxme)
library(MASS)

## ggplotでの可視化
library(survminer)
library(ggsurvfit)

## データハンドリング
library(tidyverse)
library(haven)
library(easystats)

## グラフや表関連
library(patchwork)
library(flextable)
library(ggeffects)
library(DT)
library(knitr)
library(kableExtra)
library(stargazer)
library(ggsci)
library(lemon)
library(ggplotify)

## フォント関連
library(extrafont)
require(systemfonts)
require(fontregisterer)

なお、本稿はRの基本操作とtidyverseパッケージによるデータハンドリングができることを前提としている。tidyverseパッケージを用いたデータ処理については、以下の書籍などを参照。

• R for Data Science (Wickham & Grolemund, 2016)
  電子書籍, 日本語

• R Graphics Coocbook 2nd Edition (Chang, 2018)
  電子書籍, 日本語

• RユーザのためのRstudio[実践]入門~tidyverseによるモダンな分析フローの世界 改訂2版 (松村 et al., 2021) 出版社サイト

References

Chang, W. (2018). R graphics cookbook: Practical recipes for visualizing data. “O’Reilly Media, Inc.”

Wickham, H., & Grolemund, G. (2016). R for data science: Import, tidy, transform, visualize, and model data. “O’Reilly Media, Inc.”

松村優哉., 湯谷啓明., 紀ノ定保礼., & 前田和. (2021). RユーザのためのRstudio[実践]入門 tidyverseによるモダンな分析フローの世界 改訂2版. 技術評論社.