0 パッケージの読み込み
本稿では、ゼロ過剰モデルの実行にglmmTMB
パッケージを用いる。
また、モデルチェックや結果の図示にはeasystats
パッケージとDHARMa
パッケージ、ggeffects
パッケージも用いている。
library(tidyverse)
library(lme4)
library(easystats)
library(ggeffects)
library(glmmTMB)
library(statmod)
library(DHARMa)
library(brms)
library(ggsci)
library(DT)
なお、本稿はRの基本操作とtidyverse
パッケージによるデータハンドリングができることを前提としている。tidyverse
パッケージを用いたデータ処理については、以下の書籍などを参照。
R for Data Science (Wickham & Grolemund, 2016)
電子書籍, 日本語R Graphics Coocbook 2nd Edition (Chang, 2018)
電子書籍, 日本語RユーザのためのRstudio[実践]入門~tidyverseによるモダンな分析フローの世界 改訂2版 (松村 et al., 2021) 出版社サイト
References
Chang, W. (2018). R graphics cookbook: Practical recipes for visualizing data. “O’Reilly Media, Inc.”
Wickham, H., & Grolemund, G. (2016). R for data science: Import, tidy, transform, visualize, and model data. “O’Reilly Media, Inc.”
松村優哉., 湯谷啓明., 紀ノ定保礼., & 前田和. (2021). RユーザのためのRstudio[実践]入門 tidyverseによるモダンな分析フローの世界 改訂2版. 技術評論社.